Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms