Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tspan1Q99J59 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms