Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
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