Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Klc3Q91W40 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Klc3Q91W40 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Klc3Q91W40 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klc3Q91W40 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Klc3Q91W40 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klc3Q91W40 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Klc3Q91W40 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klc3Q91W40 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Klc3Q91W40 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klc3Q91W40 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klc3Q91W40 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klc3Q91W40 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klc3Q91W40 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms