Protein–RNA interactions for Protein: Q8VED5

Krt79, Keratin, type II cytoskeletal 79, mousemouse

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Length 531 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt79Q8VED5 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt79Q8VED5 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt79Q8VED5 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt79Q8VED5 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt79Q8VED5 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt79Q8VED5 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt79Q8VED5 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt79Q8VED5 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt79Q8VED5 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt79Q8VED5 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt79Q8VED5 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt79Q8VED5 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt79Q8VED5 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt79Q8VED5 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt79Q8VED5 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt79Q8VED5 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt79Q8VED5 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt79Q8VED5 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt79Q8VED5 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt79Q8VED5 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt79Q8VED5 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt79Q8VED5 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt79Q8VED5 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt79Q8VED5 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt79Q8VED5 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt79Q8VED5 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt79Q8VED5 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Krt79Q8VED5 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt79Q8VED5 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt79Q8VED5 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt79Q8VED5 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt79Q8VED5 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Krt79Q8VED5 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt79Q8VED5 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt79Q8VED5 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Krt79Q8VED5 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Krt79Q8VED5 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Krt79Q8VED5 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Krt79Q8VED5 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt79Q8VED5 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Krt79Q8VED5 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Krt79Q8VED5 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt79Q8VED5 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt79Q8VED5 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Krt79Q8VED5 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Krt79Q8VED5 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Krt79Q8VED5 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt79Q8VED5 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt79Q8VED5 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt79Q8VED5 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt79Q8VED5 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt79Q8VED5 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt79Q8VED5 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt79Q8VED5 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt79Q8VED5 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt79Q8VED5 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt79Q8VED5 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt79Q8VED5 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt79Q8VED5 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt79Q8VED5 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt79Q8VED5 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt79Q8VED5 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms