Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
OptnQ8K3K8 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OptnQ8K3K8 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms