Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.3 ms