Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms