Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

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Length 102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Vps8-202ENSMUST00000096192 4942 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Kalrn-212ENSMUST00000114973 5253 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Cmtr1-201ENSMUST00000024816 6380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
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Gm9955Q8CEJ8 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
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Gm9955Q8CEJ8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
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Gm9955Q8CEJ8 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
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Gm9955Q8CEJ8 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
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Gm9955Q8CEJ8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
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Gm9955Q8CEJ8 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm9955Q8CEJ8 Rel-201ENSMUST00000102864 7466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
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Gm9955Q8CEJ8 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm9955Q8CEJ8 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
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Gm9955Q8CEJ8 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm9955Q8CEJ8 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm9955Q8CEJ8 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
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Gm9955Q8CEJ8 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm9955Q8CEJ8 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
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Gm9955Q8CEJ8 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Gm9955Q8CEJ8 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm9955Q8CEJ8 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm9955Q8CEJ8 Kit-201ENSMUST00000005815 5214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm9955Q8CEJ8 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm9955Q8CEJ8 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm9955Q8CEJ8 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm9955Q8CEJ8 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm9955Q8CEJ8 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm9955Q8CEJ8 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm9955Q8CEJ8 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm9955Q8CEJ8 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm9955Q8CEJ8 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm9955Q8CEJ8 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm9955Q8CEJ8 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm9955Q8CEJ8 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm9955Q8CEJ8 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm9955Q8CEJ8 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm9955Q8CEJ8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm9955Q8CEJ8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm9955Q8CEJ8 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm9955Q8CEJ8 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm9955Q8CEJ8 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm9955Q8CEJ8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm9955Q8CEJ8 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm9955Q8CEJ8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm9955Q8CEJ8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm9955Q8CEJ8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm9955Q8CEJ8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm9955Q8CEJ8 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms