Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SynpoQ8CC35 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
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