Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R0

Usp37, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 37, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp37Q8C0R0 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp37Q8C0R0 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp37Q8C0R0 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp37Q8C0R0 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp37Q8C0R0 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp37Q8C0R0 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp37Q8C0R0 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp37Q8C0R0 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp37Q8C0R0 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp37Q8C0R0 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp37Q8C0R0 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp37Q8C0R0 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp37Q8C0R0 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp37Q8C0R0 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp37Q8C0R0 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp37Q8C0R0 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp37Q8C0R0 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp37Q8C0R0 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp37Q8C0R0 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp37Q8C0R0 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp37Q8C0R0 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp37Q8C0R0 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp37Q8C0R0 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp37Q8C0R0 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp37Q8C0R0 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp37Q8C0R0 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp37Q8C0R0 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp37Q8C0R0 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp37Q8C0R0 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp37Q8C0R0 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp37Q8C0R0 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp37Q8C0R0 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp37Q8C0R0 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp37Q8C0R0 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp37Q8C0R0 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp37Q8C0R0 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp37Q8C0R0 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp37Q8C0R0 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp37Q8C0R0 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp37Q8C0R0 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp37Q8C0R0 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp37Q8C0R0 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Usp37Q8C0R0 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp37Q8C0R0 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp37Q8C0R0 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp37Q8C0R0 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp37Q8C0R0 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp37Q8C0R0 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp37Q8C0R0 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp37Q8C0R0 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp37Q8C0R0 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp37Q8C0R0 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp37Q8C0R0 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp37Q8C0R0 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp37Q8C0R0 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp37Q8C0R0 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp37Q8C0R0 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp37Q8C0R0 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp37Q8C0R0 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp37Q8C0R0 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Usp37Q8C0R0 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Usp37Q8C0R0 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp37Q8C0R0 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp37Q8C0R0 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp37Q8C0R0 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp37Q8C0R0 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp37Q8C0R0 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp37Q8C0R0 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp37Q8C0R0 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp37Q8C0R0 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp37Q8C0R0 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp37Q8C0R0 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp37Q8C0R0 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp37Q8C0R0 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp37Q8C0R0 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp37Q8C0R0 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp37Q8C0R0 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp37Q8C0R0 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp37Q8C0R0 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp37Q8C0R0 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp37Q8C0R0 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp37Q8C0R0 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp37Q8C0R0 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp37Q8C0R0 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp37Q8C0R0 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp37Q8C0R0 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp37Q8C0R0 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp37Q8C0R0 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp37Q8C0R0 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp37Q8C0R0 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp37Q8C0R0 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp37Q8C0R0 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp37Q8C0R0 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp37Q8C0R0 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp37Q8C0R0 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms