Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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FarsaQ8C0C7 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
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FarsaQ8C0C7 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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