Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms