Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms