Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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