Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Atg4dQ8BGV9 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Atg4dQ8BGV9 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Atg4dQ8BGV9 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Atg4dQ8BGV9 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
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Atg4dQ8BGV9 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms