Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
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H2-M10.4Q85ZW8 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
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H2-M10.4Q85ZW8 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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