Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZI6

Lrsam1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrsam1Q80ZI6 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrsam1Q80ZI6 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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