Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
Atg2bQ80XK6 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg2bQ80XK6 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms