Protein–RNA interactions for Protein: Q80VN0

Cfap100, Cilia- and flagella-associated protein 100, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap100Q80VN0 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms