Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms