Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 752.9 ms