Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc6aQ78XR0 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118 ms