Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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