Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim37Q6PCX9 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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