Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

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Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Zbtb40Q6PCS8 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Zbtb40Q6PCS8 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Zbtb40Q6PCS8 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Zbtb40Q6PCS8 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Zbtb40Q6PCS8 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Zbtb40Q6PCS8 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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Zbtb40Q6PCS8 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Zbtb40Q6PCS8 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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