Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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