Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
CltbQ6IRU5 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms