Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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