Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sbno1Q689Z5 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Sbno1Q689Z5 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbno1Q689Z5 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbno1Q689Z5 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbno1Q689Z5 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbno1Q689Z5 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbno1Q689Z5 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbno1Q689Z5 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbno1Q689Z5 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbno1Q689Z5 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbno1Q689Z5 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbno1Q689Z5 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbno1Q689Z5 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbno1Q689Z5 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbno1Q689Z5 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbno1Q689Z5 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbno1Q689Z5 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbno1Q689Z5 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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