Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms