Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Sall3Q62255 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Sall3Q62255 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Sall3Q62255 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms