Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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BcanQ61361 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
BcanQ61361 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BcanQ61361 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BcanQ61361 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BcanQ61361 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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BcanQ61361 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BcanQ61361 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
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BcanQ61361 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
BcanQ61361 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BcanQ61361 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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BcanQ61361 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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BcanQ61361 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BcanQ61361 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
BcanQ61361 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
BcanQ61361 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BcanQ61361 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BcanQ61361 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
BcanQ61361 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BcanQ61361 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BcanQ61361 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BcanQ61361 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BcanQ61361 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BcanQ61361 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BcanQ61361 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
BcanQ61361 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BcanQ61361 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BcanQ61361 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BcanQ61361 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BcanQ61361 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BcanQ61361 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BcanQ61361 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BcanQ61361 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
BcanQ61361 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BcanQ61361 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BcanQ61361 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BcanQ61361 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BcanQ61361 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BcanQ61361 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BcanQ61361 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BcanQ61361 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BcanQ61361 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
BcanQ61361 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BcanQ61361 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms