Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Foxg1Q60987 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Foxg1Q60987 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Foxg1Q60987 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Foxg1Q60987 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Foxg1Q60987 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Foxg1Q60987 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Foxg1Q60987 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Foxg1Q60987 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Foxg1Q60987 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Foxg1Q60987 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Foxg1Q60987 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Foxg1Q60987 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Foxg1Q60987 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Foxg1Q60987 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Foxg1Q60987 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Foxg1Q60987 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Foxg1Q60987 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Foxg1Q60987 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Foxg1Q60987 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Foxg1Q60987 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Foxg1Q60987 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Foxg1Q60987 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Foxg1Q60987 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Foxg1Q60987 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Foxg1Q60987 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Foxg1Q60987 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Foxg1Q60987 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Foxg1Q60987 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms