Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms