Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H9

Samd5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd5Q3V1H9 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Gm7680-201ENSMUST00000216198 1348 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Gm17910-201ENSMUST00000211038 838 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Gm18387-201ENSMUST00000220333 702 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 4930480M12Rik-201ENSMUST00000221084 550 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 AC133517.2-201ENSMUST00000226820 690 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Psmd10-201ENSMUST00000033805 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Gm42852-201ENSMUST00000202649 1379 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Gm10375-201ENSMUST00000100692 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samd5Q3V1H9 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms