Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
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