Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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