Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Obox3Q3UT54 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Obox3Q3UT54 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Obox3Q3UT54 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Obox3Q3UT54 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
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Obox3Q3UT54 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Obox3Q3UT54 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Obox3Q3UT54 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Obox3Q3UT54 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Obox3Q3UT54 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Obox3Q3UT54 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Obox3Q3UT54 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Obox3Q3UT54 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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