Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms