Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

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Length 985 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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