Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q3U6N9 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q3U6N9 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q3U6N9 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Q3U6N9 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q3U6N9 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q3U6N9 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Q3U6N9 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q3U6N9 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q3U6N9 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Q3U6N9 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q3U6N9 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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