Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
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Rnf149Q3U2C5 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnf149Q3U2C5 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnf149Q3U2C5 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnf149Q3U2C5 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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Rnf149Q3U2C5 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnf149Q3U2C5 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
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Rnf149Q3U2C5 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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Rnf149Q3U2C5 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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Rnf149Q3U2C5 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnf149Q3U2C5 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnf149Q3U2C5 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
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Rnf149Q3U2C5 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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Rnf149Q3U2C5 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnf149Q3U2C5 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf149Q3U2C5 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf149Q3U2C5 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf149Q3U2C5 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Rnf149Q3U2C5 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf149Q3U2C5 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf149Q3U2C5 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Rnf149Q3U2C5 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Rnf149Q3U2C5 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Rnf149Q3U2C5 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Rnf149Q3U2C5 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf149Q3U2C5 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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