Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
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