Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Adcy6-205ENSMUST00000228566 3707 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms