Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms