Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samd11Q1RNF8 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms