Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VgfQ0VGU4 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms