Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms