Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Prmt7-201ENSMUST00000071592 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 AC125409.3-201ENSMUST00000223488 653 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Gm7861-201ENSMUST00000110749 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Gm7849-201ENSMUST00000110752 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Gm22763-201ENSMUST00000158374 107 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 P2rx1-202ENSMUST00000092938 1119 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Blvra-202ENSMUST00000110389 657 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Gm2474-201ENSMUST00000195162 559 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Gm10581-201ENSMUST00000097986 231 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms